La Sección de rehabilitación infantil , junto con la Sección de Cardiología Infantil, proporciona a los niños cardiópatas, un programa de rehabilitación pionero que abarca todas las etapas del proceso, con intervención hospitalaria, ambulatoria y entrenamiento al esfuerzo y actividad física.
Para ello la sección cuenta con: fisioterapeutas, terapeutas ocupacionales y logopedas, así como gimnasio con dotación tecnológica necesaria.
El objetivo final de dicha atención, es disminuir el impacto de la cardiopatía congénita y/o cirugía sobre la funcionalidad y la calidad de vida de estos niños.